Биологи открыли супер-энхансеры, которые включают гены рака груди

Last Updated on 18.04.2021 by Perelomanet

Тройной отрицательный рак груди (TNBC) — это агрессивный тип рака груди с высокой летальностью. В настоящее время основным методом лечения является химиотерапия, но клинический результат неудовлетворителен. Группа исследователей, возглавляемая биологами из Городского университета Гонконга (CityU), определила и охарактеризовала набор специфических супер-энхансеров, которые стимулируют активность связанных критических генов рака. Исследование также показало, что удаление некоторых специфических супер-энхансеров может уменьшить рост опухолевых клеток. Последние результаты могут помочь открыть новые эффективные мишени для лекарств для пациентов с TNBC, чтобы повысить их шансы на выживание.

Традиционно исследования рака были сосредоточены на выявлении генных мутаций при различных типах рака груди . Напротив, то, как эпигенетический контур влияет на рак, остается плохо изученным.

Эпигенетические изменения: еще один способ вызвать рак

Хотя генетическая мутация — это изменение одной или нескольких частей последовательности ДНК, эпигенетическое изменение также изменяет ДНК гена, но не на уровне последовательности. Вместо этого специальные метки, называемые эпигенетическими метками, добавляются к последовательности ДНК или удаляются из нее, чтобы изменить то, как белок работает в организме. А специфические эпигенетические метки содержатся в супер-энхансерах. Следовательно, нарушение регуляции, то есть аномальная регуляция суперинхансеров, может вызвать высокую продукцию белков-драйверов рака и способствовать образованию рака.

Чтобы выяснить, как эти супер-энхансеры могут влиять на клетки TNBC, доктор Ребекка Чин Ют-мин, биолог-онколог, и доктор Ван Синь, вычислительный биолог, оба из Департамента биомедицинских наук в CityU, объединились, чтобы возглавить учеба. Их результаты были опубликованы в научном журнале Nature Communications , озаглавленном «Определение ландшафта супер-энхансеров при тройном отрицательном раке груди с помощью многомерного профилирования».

Объединив данные многоуровневого эпигеномного секвенирования для 21 клеточной линии с данными экспрессии генов и клинической информацией для более чем 4000 образцов пациентов, команда доктора Ванга использовала метод мультиомного профилирования для выполнения углубленного анализа данных и построила конкретный супер-энхансер-мишень. регуляторная сеть для всех типов рака груди.

Ключевой регулятор роста рака

«Наш комплексный анализ показывает, что кластеризация супер-энхансеров достаточна для характеристики различных подтипов рака груди», — сказал д-р Ван. «Важно отметить, что на основе регуляторной сети мы идентифицируем ген FOXC1 как ключевой регулятор роста и метастазирования рака, который управляется TNBC-специфическим суперэнхансером. FOXC1 позволяет прогнозировать выживаемость пациентов и помогает в разработке терапевтических стратегий, нацеленных на эпигенетические процессы. схем. «

Оцените статью
PerelomaNet.ru
Задайте вопрос